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通過一系列的運作，李舜臣首先被任命為加裡浦水軍佥節制使。
珍島郡守屬于地方編制，而加裡浦水軍佥節制使則隸屬正規軍，李舜臣轉了一圈，重新回歸到軍隊建制中來。
這個官職隻是李舜臣的過渡之階，柳成龍做完這一步安排，立刻上書推薦李舜臣為全羅道左水軍節度使。
以他在朝中的權勢，這份推薦很快就得到了通過。
李舜臣辛苦了大半輩子，終于當上了正三品的官。
但這一年已是萬曆十九年中，距離壬辰戰争爆發，僅僅不到一年的時間……
縱觀李舜臣的這一連串履曆，盡管跌宕起伏，無比坎坷，但同時也給了他無比豐富的基層帶軍經驗。
他一步一個腳印走過來，對于軍中——尤其是水軍——都相當熟稔，逐漸形成了自己的一套管理理論。
除了愛兵如子、賞罰分明之類老手段以外，李舜臣治軍有一個特别鮮明的特點：穩。
主帥可以有很多種特質，或慈祥，或嚴酷，或儒雅，或豪放。
但對于在戰場上的士兵來說，主帥最重要的品質，是鎮定。
隻有一名鎮定的主帥，才能讓軍心穩定，讓士兵們放心地去執行各種艱苦任務。
李舜臣的性格，是出了名的穩重。
早在鹿島屯田的時候，他與敵人弓箭對射，被一箭射中肩膀，他鎮定自若地拔出飛矢，一直到戰鬥結束，周圍的人都不知道他曾經中過一箭。
除了“穩”以外，李舜臣的秘訣還有一個字：“前”。
這一點李舜臣很象是解放戰争時期的解放軍将領，在打仗的時候喜歡高喊“跟我上”，而不是“給我沖”。
在李舜臣參與的所有戰役裡，他永遠站在最前線。
李舜臣安撫軍心的手法很有趣，他一直喜歡射箭，準備了許多羽箭随身攜帶。
每次打仗，他都把箭從容分給麾下衛士。
一是表現自己從容，讓部下放心；二是告訴普通士兵，主帥的位置與敵人隻有一箭之隔，絕沒有在背後貪生怕死，與他們并肩而戰。
所以李舜臣一生曆經無數戰役，面臨着巨大壓力，但他的麾下軍隊卻從沒慌亂過，無論面臨什麼樣的險境，他們都能夠有條不紊地去執行主帥命令，這都是拜這兩個字所賜。
在接掌全羅道水軍這一年時間裡，李舜臣牢記柳雲龍的叮囑，以日本正規水軍為假想敵，一直忙着訓練軍隊。
除此以外，他還作了一件大事——技術改造。
改造的對象，是朝鮮的一種古老戰船——龜船。
龜船的設計思路，最早來自于中國的蒙沖鬥艦。
蒙沖鬥艦是在船上設有高約三尺的女牆，船下開擎棹孔，安放排槳，船内又建起與女牆平齊的大棚。
龜船也是如此，它以闆屋船為基礎，一改傳統船艦造型，船上方與兩側用木闆平蓋遮擋，把船内裹得嚴嚴實實。
遠遠望去，好像一隻烏龜殼，所以起名為龜船。
在朝鮮，龜船最早在公元一四一三年便出現了，而且是專門為對付日本人用的。
李朝太宗曾經親身去觀摩過龜船宴席，還讓左代言卓慎研發龜船戰法。
（《裝甲龜船》）
但那個時候的龜船隻是簡單地用厚木闆擋住船體，以防敵人弓箭襲擊。
現在李舜臣想要的，是一種配合艦載火炮的全新龜船。
朝鮮水軍和朝鮮陸軍對火器的态度截然不同。
陸軍對火炮興趣冷淡，因為朝鮮火炮發射的，主要是長片箭。
這種炮彈形狀類似于火箭彈，長三點六米，直徑零點零七七米，在木箭的後面還貼着三片一米長左右的鐵闆尾翼，箭頭還用鐵镞包裹。
這種長片箭在開闊地殺傷力很有限，精準度又不及弓箭，對朝鮮陸軍來說，是有如雞肋一樣的東西；但水軍卻不一樣。
當時船隻多為木制，水上移動又慢，一旦被火箭釘上，極易被焚毀沉沒，殺傷力巨大。
因此這種火炮被裝上了戰船，成為标準裝備之一。
截止在壬辰戰争開始前，朝鮮軍戰船上已經裝備了天、地、玄、黃、勝五種口徑不同的火炮以及其他一些多管發射的小炮铳，甚至能仿造出山寨佛朗機。
但是李舜臣經過研究，發現這種方式不夠給力。
第一，戰艦上的火器數量太少；第二，戰艦本身防護力和平衡性不足，經常一炮打出去，後坐力把船震得前後颠簸，輕則影響射擊精度，重則讓船身解體；第三，朝軍水師戰術思想也很落後，還停留在火器弓箭遠攻輔助，船上步兵接舷對戰。
綜合這三點考慮，李舜臣和手底下的水軍将領鄭運、外甥李芳等人反複研讨，最終拿出了一個新式龜船的設計方案。
新式龜船用120毫米厚的厚木闆做成拱頂，擋住船首闆、船尾闆、底闆及肋骨，沒有裸露在外的舷闆。
還在外層木闆上釘着許多銳利的尖刺和六角形的甲片防護。
這個設計便從根本上杜絕了敵人跳上甲闆的威脅——就算跳上來，也進不去船内。
龜船的形狀為曲線，把這麼厚的木闆彎曲成一定角度，還要與其他部分保持密合，這在工藝上絕對是個挑戰。
李舜臣使用的是嵌接法，将外闆分成許多短部分，彼此鑲嵌，彎