蘇愛、蘇拉條約簽訂後，就輪到了立陶宛。
立陶宛低頭
按照蘇德秘密協定，立陶宛本屬德國的勢力範圍。9月28日，蘇德友好和邊界條約又将它列入蘇聯的勢力範圍。
30日，莫洛托夫召見立陶宛駐莫斯科公使，要求談判兩國關系。
10月3日，立陶宛外長到達莫斯科，斯大林提出以蘇拉、蘇愛條約為藍本，簽訂一個互助條約，條約有效期20年，戰時蘇聯駐軍5萬人。
立陶宛外長指出，蘇聯方面提出的條約草案實際上是對立陶宛的占領。
斯大林說：“蘇聯無意威脅立陶宛的獨立，相反，駐軍是對立陶宛的真正保障。
”莫洛托夫威脅道，愛沙尼亞已簽署了類似條約，拉脫維亞也表示同意，如果立陶宛拒絕，将破壞即将建成的防禦體系。
在蘇聯的壓力下，立陶宛外長被迫做出讓步，但要求把蘇聯駐軍人數縮減到2.3萬人，并隻駐紮在維爾諾地區。
斯大林當即拒絕了這一要求，提出蘇聯駐軍人數不能少于3.5萬人。
立陶宛代表團就蘇軍進駐時機等問題提出新建議，但蘇方對此不感興趣，并利用被蘇聯控制的維爾諾地區對立陶宛人施加壓力，莫洛托夫威脅說：“蘇聯政府不可能使維爾諾人民長期保持安定而不關注他們的要求。
”立陶宛人如不接受互助條約，就不能得到維爾諾。
《真理報》也不斷發出信息，聲言要把這個城市劃歸白俄羅斯。
白俄羅斯高級領導人則頻頻飛往維爾諾，以圖“接收”産業和建立蘇維埃制度。
10月10日，立陶宛代表團接受了莫洛托夫的修訂案，簽訂了内容與蘇愛、蘇拉條約相同的不平等條約，蘇聯駐軍可達2萬人。
蘇聯的矛盾“心境”
波羅的海三國對蘇聯恐吓威逼它們簽訂“互助”條約的強盜行徑敢怒不敢言，它們對斯大林集團缺乏信任，對波羅的海三國未來的前途憂心忡忡，拉脫維亞外長說：“這是拉脫維亞曆史上的轉折點。”立陶宛外長指出：立陶宛是懷着十分沉重的心情簽訂條約的。
愛沙尼亞外長則在簽約後就遞交了辭呈，以免落下“愛奸”的名聲。
在“互助”條約簽訂後的一段時間裡，由于西歐戰事的發展尚不明朗，莫斯科當