入文大分三：初、總叙一期不二宗旨，二、别立十門曆法解釋，三、融通文旨結意歸宗。
(初文分三：初、結示前章教觀宗要，又二：初、略示教觀旁正，又二：初、教正故意周，又二：初、述所談之本意。
)然者，是也，生前起後之辭。
此者，指定迹門也。
迹謂影迹，諸佛出世，化事未顯本之前，皆迹也。
經雲：是我方便，諸佛亦然。
門即能通之法也。
經雲：以種種法門，宣示於佛道。
談其因果，及以自他者，此指智者大師，以陀羅尼力，恣樂說辨，說其十妙，明法華開權顯實，唯一佛乘自行因果，化他能所等法也。
十妙者，初境妙，謂十如，十二因緣，四谛，三二一無谛等，即藏通别圓人所觀之境也。
二智妙，即四教人各觀諸境之法，共有二十智，謂四菩提等智也。
三行妙，即四教人修次第不次第五行，謂聖梵天病兒戒定慧等也。
四位妙，即四教行成，各入其位，謂藏七賢七聖，通十地，别五十二位，圓六即位也。
五三法妙，即四教各至極果，所住三軌三身三德之法也。
此之五妙，雖各四教，意在門顯，無非圓乘自行因果。
前四為自因，後一為自果。
六感應妙，即四教機随感佛，故有四句三十六句十法界機應也。
七神通妙，即四教佛欲為四機說法，先現神變，放光動地，警發物情，及示身土差别等相也。
八說法妙，即正為四機說四種十二部經，诠辨谛緣，度心佛衆生等法也。
九眷屬妙，即四教受道之人，為法眷屬也。
十利益妙，即四教人獲自行因果等益。
此之五妙，一一開顯同前，為化他能所。
(如感為他，應為自，互名能所。
神通說法，偏從能立。
眷屬利益，偏從所立。
此亦大槩各舉名數而已。
至下建立所從中更辨。
)故雲談其因果等也。
一代者，通指釋迦出世，一化始終也。
(二、故凡下，舉用義以釋成。
)故凡諸等者，明用教味之意。
四教謂橫約化法，(藏、通、别、圓。
)五味謂豎約化儀。
(頓、漸、秘密、不定。
)華嚴以圓兼别，未施小，故名頓，在初如乳。
鹿苑但是小乘經律論三藏，正施小，名漸次，乳如酪。
方等以圓對藏、通、别之漸次，酪如生蘇。
般若以圓帶通、别之漸次，生蘇如熟蘇。
秘密不定者，隻在前頓漸之中，密見密聞，悟入不定，無别時部。
法華無兼，但對帶之。
唯一圓頓，是顯露非秘密，是定非不定，純一醍醐味也。
此則待前三教四味之粗，法華得名為妙，相待妙也。
若前三教四味粗，人、理、教、行，至法華悉被開顯，鹹成圓教。
一味妙，人、理、教、行，指除糞人，即長者子，開方便門，示真實相，決了聲聞法，是諸經之王，汝等所行，是菩薩道。
此開粗即妙，唯一絕待妙也。
今約絕待，故雲意在開教，悉入醍醐也。
(二觀旁，故從略。
)樞謂之猥，門戶扉樞也，機弩互也，取其要也。
五時八教，由為觀心故立，了心由教故解，譬目足更資，方有所至。
略點下，明旁正意。
觀心莫如止觀，明教莫若玄義，故雲縱有施設，托事附法。
又如辨體章中，明四教入體之門，各列十乘觀法，名同略示，引相而已。
故雲或辨十觀，列名而已，皆是旁述耳。
(二總歎十妙宗旨，又三：初诠旨鹹妙意。
)此明演十妙之意也。
能所如前解。
诠即法華，中即十妙。
(二該叔化意。
)始末即前五妙，境為始，法為末。
不可不了者，勸辭也。
綱謂網之所依，提綱則目整。
譬若了十妙，一化教意，該收皆盡。
(三覽教成觀意。
)大體者，為止觀所修之大體也。
(二明後段法義無殊，又二。
初中明迹本離合，以顯無殊。
)從華嚴始成正覺，鹿苑初轉法輪，方等般若已來，至法華開顯會入，指大通佛所，曾說是經，今日成佛，還為汝說，皆謂實修實證。
及菩薩地湧，彌勒問如來，方雲我非今始成道。
舉塵點之喻，不能喻其久遠，此名為本。
中間今日，示生示滅，并名為迹。
雖是其迹，隻用本證因果自化之，處處化導，更無别法，名為迹法。
言離合者，非謂本望迹名離，迹即本名合，乃是本迹十妙，因果開合耳。
如本中合境智行位四妙為一本果妙，迹中雖開為四，亦俱是因，而本事已成，故沒四名，合為一耳。
又開一三法妙為本果，國土壽命涅盤四妙者，本既至昔，必有國土筍事，故沒三法一名，開為四也。
雖此開合，不出自行因果，化他能所，更無别法，名為本法。
故雲因果義一，自他何殊。
指此無殊，名不思議一也。
玄義約理事理，教教行，體用權實，今已六重而明本迹。
六名雖異，如理事至行，隻是自因，體是自果，用及權實，是化他能所，今已隻是時節異耳。
況三際不離唯心，故六重皆不思議一。
若了此意，於迹随入不二，更無他本之法，非不二也。
(二明五章總别，以顯無殊。
)況體宗用三，不出十妙。
宗即因果，體即所證，用即自他。
玄義雲：釋名總論三法，體宗用别論三法。
故知但是總别之殊，教相分别。
前之四章，對前四時三教諸部，兼但對帶為異。
玄義雲：釋名名異，乃至判教教異。
五章既是十妙，五章之外，更無他本十妙之殊也。
(三，初曉教行旨歸，彰所述之意。
又二，初叙教行旨歸。
又三，初明教理融妙。
)若曉斯旨者，即指上所辨五章十妙。
若一一曉了，方為圓解法華融妙之旨。
則能會諸教諸味之殊途，同於一乘醍醐之圓極也。
一期者，指佛出世一化也。
五時漸頓為縱，四教化法為橫。
又三世為縱，十方為橫。
指此縱橫，隻是一念三千世間，即空假中。
言三千者，謂十法界，各其相性體力，作因緣果報，本末究竟等十如是。
又一一界，互具餘九法界，即百法界。
法界十如是，即千如是。
又於此界，如複分五陰實法，衆生假名，各有千如此。
約正報正各有依，複分國土一千，是則依正共有三千。
止觀雲，三千相，相惟性，隻是一念。
一念不前，三千不後。
全一念即三千，三千即一念。
故雲一念三千世間。
言世間者，謂假依正三千有異，一一不濫，稱為世間也。
我之一念，具三千法。
彼彼一念，悉具三千。
地獄衆生無量，一一三千。
乃至諸佛無量，一二三千。
雖複彼彼無量，全我一念，非前後相。
雖無前後，彼彼宛然，名不思議。
譬帝釋宮，衆寶珠網，一目一珠，一一珠内，現一帝釋宮殿莊嚴。
如是衆珠，互相映入，衆珠鹹現。
一現之内，一一珠内，具衆珠。
帝釋依正，彼彼不雜，展轉無窮。
雖複無窮，随舉一珠，收之皆盡。
於一珠外，更無餘珠，不見其中。
我之一念，亦複如是。
能如是觀一切諸法，唯心無性，名真性空。
真空色，名妙有假。
唯一念心，名不二中。
是名一心三觀。
故雲即空假中。
中論雲：因緣所生法，我說即是空。
亦名為假名，亦名中道義。
問：向明百界千如，雲是爾。
今經不思議境，經有百界互現之文否？答：法師功德品，六根淨人，下至地獄，上至諸佛，皆身中現，即其文也。
人界既具彼十，彼亦名具人等之十。
但有明昧之珠，諸法未曾增減。
譬太虛萬像，日夜自分森羅，豈有異哉。
(二明觀行依憑)十乘者，一觀不思議境，二真正發菩提心，三巧安止觀，四破法遍，五識通塞，六道品調停，七對治助開，八知次位，九能安忍，十無法愛。
此十俱不運而運，令諸行人，乘是寶乘，直至道場，故名乘也。
起教一章者，止觀中有十大章，謂一大意，二釋名，三體相，四攝法，五偏圓，六方便，七正觀，八果報，九起教，十旨歸。
今指第九章也。
此章全是化他能所。
大意一章，則總明自行因果。
化他能所餘章，則别明自行因果。
旨歸一章，乃自他俱入秘密藏也。
(三歎功成道着)止觀全是法華，妙行則修後而證此也。
所诠即因果
(二、故更下，彰所述三意，又二：初、标立門所由。
)可解。
(二、辨名義歸趣，又三：初、依義立世名，符妙意。
)何者？征起也。
為實施權者，是法不可示，言辭相寂滅，以方便力故，於一佛乘分别說三，故雲不二而二。
開權顯實者，雖示種種道，其實為佛乘開方便門，示真實相，故雲二而不二。
法既教部鹹開成妙者，玄義雲：通則偏圓、權實、漸頓俱通，别則偏圓約法，權實約教。
漸頓根偏者，謂藏、通、别各有所诠，生滅、無生滅、無量谛緣，度心、佛、衆生、十界等法。
圓者，即中道、無作谛緣，度心、佛、衆生、三無差别、一念十界法也。
權者，謂藏、通、别各有十二分能诠教也。
實者，即圓十二分能诠教也。
部即頓漸四味，兼對帶等部。
若偏法，若權教，若漸部，至法華時，悉被開顯融會，鹹令開示悟入佛